chip和sequence的区别 chipseq和chip pcr有什么区别

在基因组调控元件分析中chip和sequence的区别，HOMER 可以用于发现新的motifHOMER 通过比较两个序列集chip和sequence的区别，再使用ZOOPS scoring zero or one occurrence per sequence和超几何检验进行富集分析HOMER主要被用于 ChIPSeq 和 promoter 分析，但是核酸序列motif寻找问题都可以尝试使用HOMERHOMER预测Motif 需要的两个序列集 HOMER。

红色为未通过如图Per base sequence content因为前15个碱基分布异常而未通过检测，可能存在序列污染或者接头没去干净一般mRNA测序数据的碱基分布都是比较均一平行的，而 ChIPseqRIPseq则可能出现比较大的碱基分布偏好 根据最后三项检测可以进一步分析是否有污染或者没去干净的接头序列存在。

如CoIP 用抗体A进行IP，然后常规是WB检测与A相互作用的BCD蛋白 这些蛋白都是预测或者说是已经有研究表明有相互作用的蛋白ChIP也基本上差不多，设计预测的一些引物，或者ChIP on Chip，sequence等。

4cseq比对如下14Cseq比对是一种生物信息学方法，它可以用来识别和比对DNA序列中的特定位点，包括结合事件基因转录水平和基因表达水平24Cseq比对能够从数据中获得有关基因结构调控方式和转录因子结合的重要知识。

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常用词汇1short修饰int，短整型数据，可省略被修饰的int2long修饰int，长整型数据，可省略被修饰的int3long long修饰int，超长整型数据，可省略被修饰的int4signed修饰整型数据，有符号数据类型5unsigned修饰整型数据，无符号数据类型6restrict用于限定和约束指针，并表。